雲林縣政府為照顧流感高危險群，降低每年冬季流感流行期間，因罹患流感導致嚴重併發症及須住院治療之機率，99年度續配合中央政策採購老人流感疫苗5萬8000劑、幼兒流感疫苗1萬1500劑提供老人與幼兒接種。

考量H5N1流感(禽流感)之可能發生時間與一般流感流行季節相當，為避免醫護人員及第一線防疫人員，因感染流感所致之發燒等症狀，引起臨床診斷之混淆，影響醫療、衛生系統之健康照護及防疫工作；同時為因應亞洲地區爆發之禽流感疫情，預防雞、鴨、鵝、豬等禽畜之養殖、運送、屠宰、活體屠宰兼販賣、化製等相關人員，有引發人類、禽類流感病毒基因重組，產生新型病毒之危機；且為保護國小一至四年級學童避免被感染造成家庭或學校群聚傳染，上述對象由衛生署提供疫苗實施接種；因此今年施打對象包括(1)65歲以上老人、機構對象及罕病患者。(2)滿6個月以上至國小入學前幼兒。(3)醫護人員、防疫人員。(4)禽畜養殖等相關行業工作人員。(5)國小一至四年級學童。(6)重大傷病患者(健保卡內註記或有證明紙卡者)。

國小學童是依衛生單位與學校協調安排時間，在學校集中接種外，餘接種對象至11月30日止，請攜帶健保IC卡、身份證等證件至衛生所或合約醫療院所施打，以達預防效果，維護健康。屆時疫苗如尚有結餘，自12月1日起以未接種之一般民眾為對象，開始辦理擴大接種，至疫苗用罄為止。

此外，今年仍提供到宅接種或至社區設立社區接種站等便民措施，本府本於敬老的精神及服務行動不便的長者，由衛生局、社會處、雲林縣醫師公會共同規畫，委由各鄉鎮市衛生所與合約醫療院所認養社區，將於10月11日起排訂時間於社區設流感疫苗暨肺炎鏈球菌疫苗接種站、到宅服務行動不便者等措施。

衛生局長吳昭軍表示，流感疫苗的保護效果除需視當年使用的疫苗株與實際流行的病毒株型別是否相符，且因每年流行的病毒型別不一定相同，其保護力於接種4～6個月後可能下降，故每年均需接種1次。而我國使用之流感疫苗，均係依世界衛生組織每年對北半球建議更新之病毒株組成，是相當安全之不活化疫苗，可與其他疫苗分開不同部位同時接種，或間隔任何時間接種，所以幼兒接種流感疫苗並不影響其他疫苗接種時程，75歲以上民眾接種流感疫苗時亦可分開不同部位同時接種肺炎鏈球菌疫苗。

凡滿6個月以上者，經醫師評估，並無對蛋之蛋白質或疫苗其他成份過敏、過去注射流感疫苗未曾發生嚴重不良反應、亦無發燒或急性病症等不適合接種等狀況，均可接種。針對少部分寶寶可能滿6個月還沒吃過雞蛋，家長或醫師無法判斷，專家建議，醫師可先行評估，除幼兒有特殊過敏體質、家族中有人對雞蛋過敏或過去施打疫苗曾有過敏反應及發燒或嚴重疾病，其餘應可接受流感疫苗注射，同時亦建議，接種流感疫苗後，應先留在醫療院所觀察半小時無恙後再離開，以應發生率極微過敏反應個案之即刻處理。

台灣歷年的流感疫情，多自11月下旬開始升溫，至聖誕節進入高峰，一般持續至農曆春節，流行期可能延長至隔年2、3月；而流感疫苗一般於接種2週後才能達到充足的保護力。幼兒若是初次接種，必須接種2劑，2劑應間隔1個月以上（過去已接種過流感疫苗，今年接種1劑即可）。為讓寶寶在流行季前完成接種，達到保護效果，衛生局呼籲，自10月1日起，請家長儘速安排時間，帶寶寶前往衛生所或合約之醫院診所接種，初次接種須接種2劑之幼兒，請務必於10月底前完成第1劑，11月底前完成第2劑。