近日環保署公布北港溪被列為污染最為嚴重的河川，蘇縣長表示縣府做得不夠，宣示強力改善。現對於沿岸的養豬場，會全面要求設置豬廁所，未設置者環保局會每星期三次不定時稽查。而對於家庭廢水污染，會加快污水下水道建置之外，也會請中央速核定補助斗南污水下水道的規劃經費，早日洗刷北港溪污染的惡名。
雲林縣環保局指出，北港溪主要污染源包括生活廢水(佔58.7％)、畜牧廢水(佔38.4％)、事業廢水(佔2.9％)，在斗六污水下水道工程，正積極在用戶接管施工，北港鎮下水道工程正在設計中，今年應可正式完成，另外斗南鎮污水下水道將納入營建署第五期建設計畫內。